Проанализируем ситуацию: ООО зарегистрировано с апреля 2025 года, фактически с момента регистрации находится на УСН, но предыдущий бухгалтер вел учет как на ОСНО. За 2025 год и 1 квартал 2026 года сдавались декларации по НДС и налогу на прибыль, выставлялись счета-фактуры с НДС, принимался входной НДС к вычету, налог на прибыль рассчитывался и уплачивался. Позже выяснилось, что организация с самого начала должна была применять УСН, условия применения спецрежима не нарушены, лимиты по доходам, численности работников и стоимости основных средств сохранены.
Разберем по шагам, как исправить такую ситуацию, что делать с отчетностью за прошлые периоды, как поступить с НДС, налогом на прибыль, декларацией по УСН, переплатой на ЕНС и документооборотом за 2 квартал 2026 года.
Главный вывод: если организация действительно применяет УСН с момента регистрации и право на УСН не утрачено, нельзя «оставить 1 квартал 2026 года как ОСНО», а со 2 квартала начать работать как на УСН. Налоговый режим не выбирается поквартально по желанию бухгалтера. Если УСН применялась с регистрации и условия режима соблюдены, исправляем учет так, как будто организация все это время была на УСН. Но по НДС есть важное исключение: если организация, освобожденная от НДС, выставляла покупателям счета-фактуры с выделенным НДС, этот НДС обычно придется оставить к уплате по п. 5 ст. 173 НК РФ.
Рассмотрим подробнее первый этап. Перед исправлением деклараций и перепроведением учета убедимся, что организация действительно находится на УСН. Для этого проверьте не только слова предыдущего бухгалтера, но и документы.
Найдите уведомление о переходе на УСН по форме 26.2-1, которое подавалось при регистрации ООО или в установленный срок после регистрации.
Проверьте отметку налогового органа, квитанцию о приеме электронного уведомления или информацию в личном кабинете налогоплательщика.
Запросите в ИФНС информационное письмо или проверьте применяемый режим через электронные сервисы, если есть сомнения.
Проверьте объект налогообложения по УСН: «доходы» или «доходы минус расходы».
Проверьте лимиты по доходам, остаточной стоимости основных средств, численности работников и доле участия других организаций.
Отдельно проверьте лимит доходов для освобождения от НДС на УСН, потому что с 2025 года для упрощенцев действует особый порядок по НДС.
Если по документам подтверждается, что ООО применяет УСН с апреля 2025 года, значит, декларации по налогу на прибыль были представлены ошибочно, а декларации по НДС нужно анализировать отдельно: они могут быть ошибочными полностью или частично, в зависимости от того, выставлялись ли счета-фактуры с выделенным НДС.
Разберем важный нюанс, из-за которого в такой ситуации чаще всего возникают споры с контрагентами и налоговой. С 2025 года организации и ИП на УСН признаются плательщиками НДС, но для них предусмотрено автоматическое освобождение от исполнения обязанностей по исчислению и уплате НДС при соблюдении лимитов доходов.
Для рассматриваемой ситуации важно проверить два периода отдельно.
2025 год. Если организация на УСН имела право на освобождение от НДС и не превысила установленный порог доходов, она не должна была начислять НДС по обычным правилам, вести книгу покупок и заявлять входной НДС к вычету. Но если покупателям были выставлены счета-фактуры с выделенным НДС, сумму НДС из этих счетов-фактур нужно уплатить в бюджет по п. 5 ст. 173 НК РФ.
2026 год. Для освобождения от НДС с 01.01.2026 проверьте доходы за 2025 год. Если доходы за 2025 год не превысили 20 млн руб. и в 2026 году доходы с начала года также не превысили установленный порог, организация на УСН освобождена от НДС. В этом случае со 2 квартала 2026 года нужно оформлять реализацию без НДС, не выставлять счета-фактуры с выделенным НДС и не заявлять входной НДС к вычету.
Важно: если в 1 квартале 2026 года покупателям уже выставлены счета-фактуры с выделенным НДС, нельзя просто подать нулевую уточненную декларацию по НДС и забыть о налоге. В уточненной декларации должны остаться суммы НДС, предъявленные покупателям в счетах-фактурах. А вот входной НДС, который организация ошибочно приняла к вычету как плательщик на ОСНО, придется убрать.
Рассмотрим подробнее ответ из обсуждения: «уточненная по НДС не будет нулевой». Это означает следующее.
Если ООО на УСН было освобождено от НДС, но выставило покупателю счет-фактуру с выделенной суммой НДС, включается п. 5 ст. 173 НК РФ. По этой норме лицо, которое не должно было начислять НДС, но само выделило налог покупателю, обязано уплатить в бюджет сумму НДС, указанную в счете-фактуре.
Посмотрим на пример. ООО на УСН выставило покупателю акт и счет-фактуру на 122 000 руб., в том числе НДС 22 000 руб. Несмотря на то что организация применяет УСН и имеет освобождение от НДС, сумма 22 000 руб. уже предъявлена покупателю. Значит, в уточненной декларации по НДС эту сумму нельзя обнулить только потому, что организация оказалась на УСН. Ее нужно показать как НДС к уплате по выставленному счету-фактуре.
Но при этом организация на УСН с освобождением от НДС не имеет обычного права на вычет входного НДС, как налогоплательщик на ОСНО. Поэтому входной НДС от поставщиков, который ошибочно попал в книгу покупок и уменьшил налог к уплате, нужно снять из вычетов.
Итоговая логика по НДС такая:
НДС, выделенный в выданных покупателям счетах-фактурах, оставляем к уплате.
Входной НДС, ошибочно заявленный к вычету, убираем.
Книгу покупок по ошибочным вычетам корректируем.
В уточненной декларации по НДС отражаем обязанность по НДС только в той части, которая возникает из-за выставленных счетов-фактур с НДС, налогового агентирования, импорта или иных специальных случаев.
Если в каком-то квартале счетов-фактур с выделенным НДС не было и специальных обязанностей по НДС не возникало, тогда декларация за такой квартал может быть нулевой или вообще не должна была представляться, но конкретный вариант нужно оценивать по уже поданной отчетности и требованиям ИФНС.
Ключевой риск: после снятия входных вычетов сумма НДС к уплате может не уменьшиться, а увеличиться. Поэтому перед подачей уточненных деклараций сначала рассчитайте результат по каждому кварталу.
Проанализируем ситуацию с покупателями и поставщиками. Автор вопроса справедливо опасается: покупатели на ОСНО уже зарегистрировали ваши счета-фактуры в книге покупок и приняли НДС к вычету, а поставщики выставляли вам счета-фактуры с НДС, которые предыдущий бухгалтер включал в книгу покупок.
Разделим контрагентов на две группы.
Покупатели. Если вы выставили покупателям счета-фактуры с выделенным НДС, а затем оставляете эти счета-фактуры в силе и уплачиваете НДС по п. 5 ст. 173 НК РФ, то вы не обнуляете НДС у покупателей через исправительные документы. В этом варианте вы не заставляете покупателей массово корректировать книгу покупок только потому, что у вас был неверно настроен налоговый режим в 1С. Но налоговые последствия для покупателей все равно лучше согласовать с ними индивидуально, особенно если суммы крупные.
Поставщики. Поставщики на ОСНО выставляли вам документы с НДС законно, если они сами являются плательщиками НДС. Исправлять их документы обычно не нужно. Проблема не в поставщиках, а в том, что ваша организация на УСН с освобождением от НДС не должна была принимать этот входной НДС к вычету. В учете УСН входной НДС отражайте по правилам упрощенной системы: включайте в стоимость активов, товаров, работ, услуг или в расходы при объекте «доходы минус расходы», если выполнены условия признания расходов.
Разберем два возможных варианта работы с покупателями.
Без исправления документов покупателям. Оставляем ранее выставленные счета-фактуры с НДС, уплачиваем НДС из них в бюджет, подаем уточненные декларации с начисленным НДС и без входных вычетов. Этот вариант обычно меньше затрагивает покупателей, но может быть дороже для вашей организации из-за невозможности вычетов.
С исправлением документов покупателям. Пытаемся переоформить реализацию как «без НДС» через исправительные документы, дополнительные соглашения и возврат или перерасчет цены. Этот вариант может создать проблемы покупателям: им придется корректировать вычеты, доплачивать НДС и пени, отвечать на требования ИФНС. Используйте такой вариант только после юридического анализа договоров, согласования с покупателями и понимания последствий.
На практике для закрытых периодов часто безопаснее не ломать документооборот с покупателями, а признать обязанность по НДС по выставленным счетам-фактурам и убрать только ошибочные вычеты. Но окончательное решение принимайте после расчета сумм и оценки договорных отношений.
Теперь разберем налог на прибыль. Организация на УСН не является плательщиком налога на прибыль по обычной деятельности, за исключением специальных случаев, например отдельных доходов, облагаемых по особым ставкам. Если ООО вело обычную деятельность на УСН, но ошибочно сдавало декларации по налогу на прибыль и платило налог, нужно исправить отчетность.
Порядок действий такой:
Сформируйте оборотно-сальдовую ведомость по счету 68.04 или другому субсчету расчетов по налогу на прибыль, который используется в вашей базе 1С.
Проверьте, какие суммы налога на прибыль были начислены в 2025 году и в 1 квартале 2026 года.
Проверьте, не было ли у организации доходов, по которым налог на прибыль действительно должен был уплачиваться даже при УСН.
Если таких доходов не было, подготовьте уточненные декларации по налогу на прибыль с нулевыми показателями или с показателями, соответствующими фактическому отсутствию обязанности по налогу.
После подачи уточненных деклараций дождитесь отражения уменьшения совокупной обязанности на ЕНС.
Важно: если ранее в бухгалтерском учете через закрытие месяца начислялся налог на прибыль проводкой по счетам 99 и 68.04, после перевода учета на УСН и перепроведения закрытия месяца эти начисления должны быть исправлены. Если начисления делались ручными операциями, их нужно сторнировать или откорректировать отдельной бухгалтерской справкой.
Рассмотрим обязательный этап, который нельзя пропустить. Если ООО с апреля 2025 года находилось на УСН, оно должно было подать декларацию по УСН за 2025 год. Для организаций срок представления декларации по УСН за 2025 год — не позднее 25 марта 2026 года.
Если декларация по УСН за 2025 год не была подана, подайте ее как можно быстрее. Одновременно рассчитайте налог по УСН и пени, если налог или авансовые платежи не были уплачены в срок.
Разберем порядок действий:
В 1С настройте режим УСН с даты начала применения режима.
Проверьте объект налогообложения: «доходы» или «доходы минус расходы».
Перепроведите документы с апреля 2025 года.
Сформируйте Книга учета доходов и расходов.
Проверьте доходы по кассовому методу: поступления на расчетный счет, в кассу, зачеты взаимных требований, иные формы оплаты.
Если объект «доходы минус расходы», проверьте расходы: они должны быть экономически обоснованы, документально подтверждены, оплачены и предусмотрены закрытым перечнем расходов для УСН.
Сформируйте Декларация по УСН за 2025 год.
Пополните ЕНС на сумму налога и пеней, если после пересчета образуется недоимка.
Отправьте декларацию по УСН в ИФНС.
За просрочку декларации по УСН возможен штраф по ст. 119 НК РФ. Обычно штраф составляет 5% от неуплаченной в срок суммы налога за каждый полный или неполный месяц просрочки, но не более 30% и не менее 1 000 руб. Если налог был фактически уплачен через ЕНС, но отчетность не была сдана, отдельно проанализируйте расчет штрафа и подготовьте пояснения при необходимости.
Теперь посмотрим на 1 квартал 2026 года. Его нельзя оставить «как ОСНО», если организация применяет УСН и не утратила право на спецрежим. Но по НДС, как мы уже разобрали, придется учитывать фактически выставленные счета-фактуры с выделенным НДС.
Порядок исправления за 1 квартал 2026 года такой:
Рассчитайте авансовый платеж по УСН за 1 квартал 2026 года.
Если уведомление об исчисленных суммах авансового платежа по УСН за 1 квартал не подавалось, подайте его как можно быстрее.
Если аванс по УСН не был уплачен, пополните ЕНС и рассчитайте пени.
Уточните декларацию по налогу на прибыль за 1 квартал 2026 года, если она была подана ошибочно.
Уточните декларацию по НДС за 1 квартал 2026 года: оставьте НДС по выставленным счетам-фактурам, снимите входные вычеты, проверьте разделы декларации.
Если в 1 квартале 2026 года счета-фактуры с НДС не выставлялись, специальных обязанностей по НДС не было, а декларация по НДС была сдана ошибочно, подготовьте уточненную декларацию с учетом фактических нулевых обязанностей.
Для декларации по НДС в ситуации с выставленными счетами-фактурами ориентируйтесь на разделы, которые отражают сведения по лицам, указанным в п. 5 ст. 173 НК РФ. В типовой логике это не обычная декларация плательщика ОСНО с книгой покупок и полноценными вычетами, а декларация, где отражается НДС, выделенный в выданных счетах-фактурах. В 1С проверьте заполнение Раздел 12 декларации по НДС и сумму к уплате в Раздел 1.
Разберем вопрос автора: что делать с отчетностью за 2 квартал 2026 года. Если организация на УСН, условия применения УСН сохранены, доходы за 2025 год не превысили 20 млн руб. и в 2026 году порог для освобождения от НДС также не превышен, работаем как упрощенец с освобождением от НДС.
Тогда за 2 квартал 2026 года:
Не сдавайте декларацию по налогу на прибыль по обычной деятельности.
Не сдавайте декларацию по НДС, если не выставляли счета-фактуры с выделенным НДС, не были налоговым агентом по НДС, не было импорта и иных специальных оснований.
Оформляйте реализацию покупателям без НДС.
Не выставляйте счета-фактуры с выделенным НДС покупателям, если нет обязанности по НДС.
Не регистрируйте входные счета-фактуры поставщиков в книге покупок для вычета НДС.
Рассчитайте авансовый платеж по УСН за полугодие 2026 года.
Подайте Уведомление об исчисленных суммах налогов по авансовому платежу УСН за полугодие.
Пополните ЕНС на сумму аванса по УСН в установленный срок.
В 2026 году по авансовым платежам УСН за полугодие ориентируйтесь на общий порядок: уведомление подается до срока уплаты аванса, а сам аванс уплачивается через ЕНС. Если срок попадает на выходной, применяется перенос на ближайший рабочий день. Для полугодия 2026 года практически ориентируйтесь на конец июля: уведомление — до 27 июля 2026 года, уплата — до 28 июля 2026 года.
Если доходы за 2025 год превысили 20 млн руб. или в 2026 году превышен порог освобождения от НДС, порядок будет другим. Организация останется на УСН, но начнет исполнять обязанности по НДС. Тогда за 2 квартал 2026 года нужно будет определить выбранный вариант НДС: специальные ставки для УСН без вычетов или общеустановленные ставки с правом на вычеты. В этом случае декларация по НДС за 2 квартал понадобится. Но по условию вопроса автор указывает, что условия УСН и лимиты сохранены, поэтому основной сценарий — работа на УСН без НДС.
Теперь разберем техническую часть в 1С. Перед любыми изменениями сделайте копию базы. Исправление налогового режима задним числом затрагивает документы реализации, поступления, НДС, закрытие месяца, налог на прибыль и УСН. Поэтому сначала создайте резервную копию и зафиксируйте текущее состояние учета.
Далее выполните настройку режима налогообложения.
Откройте раздел Главное.
Перейдите в Налоги и отчеты.
Откройте вкладку Система налогообложения.
Укажите УСН с даты начала применения режима.
Выберите объект налогообложения: «доходы» или «доходы минус расходы».
Проверьте настройки НДС на УСН. Если организация освобождена от НДС, не включайте режим полноценного учета НДС с вычетами.
Проверьте вкладку Учетная политика и настройки расходов, если применяется объект «доходы минус расходы».
Проверьте настройки зарплаты, страховых взносов и уменьшения налога, если объект «доходы».
После изменения настроек не ограничивайтесь формальным переключением режима. Нужно пересчитать учет с даты регистрации или с даты начала применения УСН.
Перепроведите банковские документы: Поступление на расчетный счет, Списание с расчетного счета.
Перепроведите документы реализации: Реализация товаров и услуг, Акт об оказании услуг, УПД.
Перепроведите документы поступления: Поступление товаров и услуг, Поступление актов, Поступление дополнительных расходов.
Проверьте документы Счет-фактура выданный и Счет-фактура полученный.
Проверьте операции НДС: Формирование записей книги покупок, Формирование записей книги продаж, Помощник по учету НДС.
Перепроведите Закрытие месяца с апреля 2025 года по текущий период.
Проверьте, что регламентная операция по налогу на прибыль больше не начисляет налог как на ОСНО.
Сформируйте Книга учета доходов и расходов и проверьте налоговую базу по УСН.
Важно: если период уже закрыт и бухгалтерская отчетность утверждена, не вносите изменения механически без внутренней бухгалтерской справки. Зафиксируйте причину исправления: организация применяла УСН, но учет ошибочно велся как ОСНО. Для существенных сумм согласуйте порядок исправлений с руководителем и налоговым консультантом.
Рассмотрим подробнее НДС в 1С. Здесь не нужно просто удалять все счета-фактуры. Сначала разделите документы на две группы.
Первая группа — выданные счета-фактуры покупателям с выделенным НДС. Если эти документы уже переданы покупателям и покупатели приняли их к учету, обычно их оставляют и отражают НДС к уплате по п. 5 ст. 173 НК РФ. В 1С проверьте, чтобы сумма НДС из выданных счетов-фактур попала в декларацию как сумма налога, подлежащая уплате лицом, выставившим счет-фактуру с НДС.
Вторая группа — полученные счета-фактуры от поставщиков. По ним нельзя оставлять вычет, если организация применяет УСН с освобождением от НДС. Поэтому уберите регистрацию входного НДС в книге покупок. В зависимости от настроек базы это может потребовать отмены документов Формирование записей книги покупок, изменения способа учета НДС в документах поступления или дополнительных корректировок.
Разберем последовательность:
Сформируйте отчет Книга покупок по каждому кварталу 2025 года и 1 кварталу 2026 года.
Составьте список входных счетов-фактур, по которым был заявлен вычет.
Проверьте, как в 1С отражен входной НДС: на счете 19, списан на 68.02 или включен в стоимость.
Снимите ошибочные вычеты по НДС.
Если применяется УСН «доходы минус расходы», проверьте, как входной НДС должен участвовать в расходах по УСН.
Сформируйте уточненную декларацию по НДС по каждому кварталу.
Проверьте, что в декларации нет ошибочных вычетов из книги покупок.
Проверьте, что НДС из выданных счетов-фактур остался к уплате.
Если после снятия вычетов НДС к уплате увеличился, сначала пополните ЕНС на сумму недоимки и пеней, а затем подавайте уточненную декларацию. Такой порядок снижает риск штрафа за неуплату налога.
Теперь посмотрим на налог на прибыль в 1С. Если учет велся как ОСНО, программа могла начислять налог на прибыль при закрытии месяца. После перевода базы на УСН эти начисления должны исчезнуть или быть сторнированы.
Разберем по шагам:
Сформируйте Оборотно-сальдовая ведомость по счету 68.04.
Сформируйте Оборотно-сальдовая ведомость по счету 99 и проверьте начисления налога на прибыль.
Откройте Закрытие месяца за каждый месяц с апреля 2025 года.
Проверьте, какие регламентные операции рассчитывали налог на прибыль.
После изменения системы налогообложения перепроведите закрытие месяца.
Если начисления налога на прибыль были введены вручную через Операция, введенная вручную, подготовьте сторнирующие операции.
Сформируйте уточненные декларации по налогу на прибыль.
Если налог на прибыль был уплачен на ЕНС, после подачи уточненных деклараций сумма уменьшения обязанности должна отразиться в сальдо ЕНС. Но учитывайте, что при уточнении налога к уменьшению переплата обычно становится доступна не мгновенно, а после завершения камеральной проверки.
После исправления НДС и налога на прибыль нужно рассчитать настоящий налог, который организация должна была платить с самого начала: налог при УСН.
В 1С используйте следующие объекты и отчеты:
Книга учета доходов и расходов — основной регистр налогового учета по УСН.
Анализ учета по УСН — для проверки доходов, расходов и спорных сумм.
Декларация по УСН — для годовой отчетности.
Уведомление об исчисленных суммах налогов — для авансовых платежей по УСН в течение года.
Закрытие месяца — для регламентного расчета расходов и финансового результата.
Если объект УСН — «доходы», проверьте все поступления денег. При УСН доходы признаются в основном кассовым методом. Это означает, что важны даты поступления денег на расчетный счет, в кассу или даты иного погашения задолженности.
Если объект УСН — «доходы минус расходы», проверьте не только оплату, но и условия признания расходов. Расход должен быть в перечне расходов для УСН, должен быть подтвержден документами, оплачен и, для отдельных видов расходов, дополнительно принят к учету, реализован или списан по специальным правилам.
Не переносите механически налоговую базу по прибыли в декларацию УСН. Налог на прибыль и УСН рассчитываются по разным правилам. По налогу на прибыль применяется метод начисления или кассовый метод при соблюдении условий, а по УСН действует свой порядок признания доходов и расходов.
Теперь разберем переплату. Предыдущий бухгалтер уплачивал НДС и налог на прибыль, хотя организация должна была платить УСН. После исправления отчетности на ЕНС может появиться положительное сальдо, но не всегда сразу и не всегда в ожидаемой сумме.
Порядок действий такой:
Сначала рассчитайте настоящие обязательства по УСН, НДС по выставленным счетам-фактурам, пени и возможные штрафы.
Подайте декларацию по УСН за 2025 год и уведомления по авансам за 2026 год, если они не были поданы.
Подайте уточненные декларации по налогу на прибыль к уменьшению.
Подайте уточненные декларации по НДС с учетом п. 5 ст. 173 НК РФ и снятия входных вычетов.
Дождитесь завершения камеральных проверок уточненных деклараций к уменьшению.
Закажите сверку расчетов с бюджетом и проверьте сальдо ЕНС.
Если сальдо положительное, распорядитесь переплатой: оставьте на будущие платежи, зачтите в счет текущих обязательств или подайте заявление на возврат.
Важно: при подаче уточненной декларации к уменьшению сальдо ЕНС обычно меняется после завершения камеральной проверки. Поэтому не рассчитывайте, что переплата по налогу на прибыль сразу автоматически закроет недоимку по УСН или НДС. Если по УСН или НДС уже есть срок уплаты, лучше пополнить ЕНС, чтобы не получить отрицательное сальдо, требования и пени.
Формально уточненные декларации можно подать без отдельного письма, если все исправления понятны из отчетности. Но в такой ситуации лучше подготовить пояснение в налоговый орган. Это особенно полезно, если ранее организация стабильно сдавала отчетность как ОСНО, а затем резко подает декларацию по УСН и уточняет НДС и прибыль.
В пояснении кратко укажите:
ООО зарегистрировано с апреля 2025 года.
С момента регистрации организация применяет УСН на основании уведомления.
Право на УСН не утрачено.
Отчетность по ОСНО была представлена ошибочно.
Организация представляет декларацию по УСН и уточненные декларации по налогам, которые были отражены неверно.
По НДС суммы, предъявленные покупателям в счетах-фактурах, отражаются с учетом п. 5 ст. 173 НК РФ.
Входной НДС, ошибочно заявленный к вычету, исключается.
Такое пояснение можно отправить через 1С-Отчетность, личный кабинет налогоплательщика или другой оператор ЭДО. В 1С используйте функционал отправки неформализованного письма в налоговый орган, если он подключен.
Разберем отдельно вопрос автора: можно ли 1 квартал 2026 года оставить со сданными декларациями и уплаченными налогами, а со 2 квартала уже вести расчеты и документооборот как на УСН.
Ответ: оставить 1 квартал 2026 года как ОСНО нельзя, если организация не переходила на ОСНО и не утратила право на УСН. Налоговый режим применяется не по факту того, какие декларации ошибочно сдал бухгалтер, а по нормам НК РФ и поданному уведомлению о применении УСН.
Но это не означает, что все декларации за 1 квартал 2026 года станут нулевыми. Правильный подход такой:
По УСН — рассчитайте аванс за 1 квартал 2026 года и подайте уведомление, если оно пропущено.
По налогу на прибыль — уточните отчетность, потому что обычной обязанности по налогу на прибыль при УСН нет.
По НДС — не обнуляйте налог из выставленных счетов-фактур. Оставьте НДС, предъявленный покупателям, и снимите входные вычеты.
По документообороту со 2 квартала — прекратите выставлять счета-фактуры с НДС, если организация освобождена от НДС.
Таким образом, 1 квартал нужно исправить не «в ноль», а в соответствии с реальным статусом организации на УСН и фактически выставленными документами.
Теперь соберем все действия в один рабочий алгоритм.
Подтвердите УСН. Найдите уведомление о переходе на УСН, проверьте объект налогообложения и дату начала применения режима.
Проверьте лимиты. Убедитесь, что право на УСН не утрачено, а для 2026 года проверьте доходы за 2025 год на предмет освобождения от НДС.
Сделайте копию базы 1С. До исправлений обязательно создайте резервную копию.
Исправьте настройки 1С. В разделе Главное — Налоги и отчеты установите УСН и корректный объект налогообложения.
Перепроведите документы. Начните с даты регистрации или даты начала УСН: банк, касса, поступления, реализации, закрытие месяца.
Разберите НДС. Оставьте НДС по выданным счетам-фактурам, уберите входные вычеты, проверьте декларации по каждому кварталу.
Разберите налог на прибыль. Подготовьте уточненные декларации по налогу на прибыль, если обычной обязанности по этому налогу не было.
Рассчитайте УСН за 2025 год. Сформируйте Книга учета доходов и расходов и декларацию по УСН.
Рассчитайте УСН за 2026 год. Подготовьте уведомление по авансовому платежу за 1 квартал, если оно не подано, и продолжайте учет по УСН во 2 квартале.
Пополните ЕНС. До подачи уточненок к доплате внесите недостающие суммы налога и пеней.
Подайте отчетность. Отправьте декларацию по УСН, уточненные декларации по прибыли и НДС.
Подготовьте пояснение. Объясните ИФНС, что отчетность по ОСНО сдавалась ошибочно, а организация применяет УСН с регистрации.
Проведите сверку ЕНС. После камеральных проверок уточненок проверьте сальдо и распорядитесь переплатой.
Исправьте документооборот. С текущего периода оформляйте документы покупателям без НДС, если освобождение от НДС сохраняется.
Посмотрим на типовые ошибки, которые могут усугубить ситуацию.
Подать нулевые декларации по НДС за периоды, где были счета-фактуры с НДС. Это рискованно, потому что НДС, предъявленный покупателям, подлежит уплате по п. 5 ст. 173 НК РФ.
Оставить входной НДС к вычету. Если организация освобождена от НДС на УСН, обычные вычеты по книге покупок применять нельзя.
Не подать декларацию по УСН за 2025 год. Даже если были уплачены другие налоги, обязанность по декларации УСН сохраняется.
Оставить налог на прибыль без уточнения. Если организация не была плательщиком налога на прибыль по обычной деятельности, ошибочные начисления нужно исправить.
Сразу вернуть всю переплату с ЕНС. Сначала убедитесь, что закрыты УСН, НДС по выставленным счетам-фактурам, пени и возможные штрафы.
Массово исправить документы покупателям без согласования. Это может создать налоговые проблемы контрагентам и привести к претензиям по договорам.
Исправить только отчетность, но не учет в 1С. Если база продолжит считать ОСНО, ошибки будут повторяться в следующих кварталах.
Разберем финальный рабочий порядок на текущий период. Если ООО на УСН освобождено от НДС, со 2 квартала 2026 года оформляйте документы так:
В договорах с покупателями указывайте цену без НДС или формулировку о применении УСН и освобождении от НДС.
В документах реализации в 1С выбирайте ставку «Без НДС».
Не создавайте Счет-фактура выданный без необходимости.
В первичных документах используйте формулировку «Без НДС».
Не формируйте книгу продаж и книгу покупок для обычных операций, если нет обязанности по НДС.
Входной НДС от поставщиков не принимайте к вычету, а учитывайте по правилам УСН.
Контролируйте доходы с начала 2026 года, чтобы не пропустить превышение лимита для НДС.
В конце полугодия рассчитайте авансовый платеж по УСН и подайте уведомление.
Если покупатели на ОСНО просят счет-фактуру с НДС, объясните им, что организация применяет УСН и освобождена от НДС. Выставление счета-фактуры с НДС ради удобства покупателя приведет к обязанности уплатить этот НДС в бюджет, но не даст вашей организации права на входные вычеты, если освобождение от НДС сохраняется. Поэтому такие документы не оформляйте без отдельного управленческого решения и расчета налоговой нагрузки.
Подведем итог. Если ООО с момента регистрации находится на УСН, но ошибочно вело учет как на ОСНО, нужно восстановить правильную картину учета: подать декларацию по УСН, уточнить налог на прибыль, пересчитать НДС и исправить настройки 1С.
По налогу на прибыль обычно подаются уточненные декларации с уменьшением обязательств, потому что организация на УСН не платит налог на прибыль по обычной деятельности. По УСН, наоборот, нужно рассчитать налог за 2025 год, подать декларацию и уплатить налог, пени и возможный штраф за просрочку отчетности.
По НДС действуйте осторожно. Если организация на УСН была освобождена от НДС, но выставляла покупателям счета-фактуры с выделенным НДС, уточненная декларация по НДС не будет полностью нулевой. НДС из выданных счетов-фактур оставьте к уплате по п. 5 ст. 173 НК РФ, а входные вычеты снимите. Именно поэтому после исправления НДС может возникнуть не переплата, а доплата.
За 2 квартал 2026 года работайте уже корректно: если право на освобождение от НДС сохраняется, не сдавайте декларации по НДС и прибыли по обычным операциям, не выставляйте счета-фактуры с НДС, ведите учет на УСН, рассчитайте авансовый платеж по УСН за полугодие и подайте уведомление об исчисленных суммах.
Переплату по ошибочно уплаченным налогам используйте только после того, как уточненные декларации пройдут камеральную проверку и суммы отразятся на ЕНС. После этого переплату можно оставить на будущие платежи, зачесть в счет текущих обязательств или вернуть на расчетный счет по заявлению.
Информация носит справочный характер